海湾GST-5000主机故障一般可分为两类，
一类为控制器内部部件产生的故障，如主备电故障、总线故障等；另一类是现场设备故障，如探测器故障、模块故障等。 故障发生时，可按“消音”键终止故障警报声。
若主电掉电，采用备电供电，处于充满状态的备电可维持控制器工作 8 小时以上，直至备电自动保护；在备电自动保护后，为提示用户消防报警系统已关闭，控制器会提示 1 小时的故障声（GB 4717-2005 的要求） ；在使用过备电供电后，需要尽快恢复主电供电并给电池充电48 小时，以防蓄电池损坏。
若系统发生故障，应及时检修，若需关机，应做好详细记录。
若为现场设备故障，应及时维修，若因特殊原因不能及时排除的故障，应利用系统提供的设备屏蔽功能将设备暂时从系统中屏蔽，待故障排除后再利用取消屏蔽功能将设备恢复。